De belangrijkste taak van de Dienst betreft het in kaart brengen van de zee, het uitgeven van zeekaarten en daarmee samenhangende hydrografische publicaties.
Het totale gebied omvat het Nederlands continentaal plat en de wateren rondom de Nederlandse Antillen en Aruba.
Aan de wal, bij het Bureau Hydrografie in Den Haag, worden de meetgegevens en verdere relevante informatie verzameld zoals betonning, lichten etc. Deze worden opgeslagen in een grote digitale databank. Uiteindelijk worden hieruit de zeekaarten, de 1800 serie - officiƫle zeekaarten voor kust- en binnenwateren, zeemansgidsen, stroomatlassen, getijtafels en Berichten aan Zeevarenden(BaZ) gepubliceerd.
De Dienst der Hydrografie verzorgt niet alleen zeekaarten en hydrografische publicaties. Door de uitgebreide nautische kennis en expertise worden ook ondersteunende diensten bewezen aan het opereren van de Koninklijke Marine. Deze diensten omvatten zowel hydrografische-, oceanografische-, meteorologische-, als marien geodetische informatie.